En France, deux sous-espèces de cormorans sont représentées sur le territoire :

• une sous-espèce principalement continentale, Phalacrocorax carbo sinensis ;
• une sous-espèce principalement maritime, Phalacrocorax carbo carbo.
  Le grand cormoran est une espèce d’oiseau piscivore protégée et sa destruction est interdite conformément à l’article L.411-1 du code de l’environnement et à l’arrêté ministériel du 29 octobre 2009.
  Depuis 1979, est mis en place un système dérogatoire à la protection stricte de l’espèce pour la sous-espèce continentale. L'arrêté ministériel du 24 février 2025 fixe les conditions et limites dans lesquelles des dérogations aux interdictions de destruction peuvent être accordées par les préfets concernant les grands cormorans (Phalacrocorax carbo sinensis).
  L'arrêté ministériel du 03 septembre 2025 fixe les plafonds départementaux dans les limites desquelles des dérogations aux interdictions de destruction peuvent être accordées par les préfets concernant les grands cormorans pour la période 2025-2028.